motif是什么意思的简单介绍
分子生物学中的 motif 是什么意思,请给详细解释。
Motif(模体)指的是蛋白质分子结构中介于二级结构与三级结构之间的一个结构层次,又称超二级结构(super-secondary structure)。在蛋白质中,特别是球蛋白中,经常可以看到由若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成的有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体。
motif是什么意思 《法语助手》法汉
法汉-汉法词典

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n. m.
1动机; 理由, 原因
2(绘画的)主题
3装饰图案, 花样
4[乐]动机
常见用法
les motifs d'un papier peint一种墙纸上的图案
近义、反义、派生词典
近义词:
fondement, intention, mobile, raison, cause, objet, prétexte, attendu, considérant, dessin, leitmotiv, thème, sujet, source, explication, excuse, justification, titre, pourquoi, moteur
反义词:
conséquence, effet
《当代法汉科技词典》
1. n. m.
【法律】判决[处罚]理由
2. n. m.
【物理学】晶体结构
3. n. m.
【音乐】动机
motif
m.
动机; 理由; 模式; 花纹
法语例句
1.
Quel motif le pousse?
是什么动机促使他的?
2.
Quel motif le pousse à faire ça?真人慢速
是什么动机促使他这样做的?
3.
Il ne donne aucun motif valable.
他给不出正当的理由。
4.
Elle était tellement fatiguée qu'elle s'est mise à pleurer brusquement, sans motif.
她太累了,以至于没有原因的突然哭了起来。
5.
Les motifs du harnais sont très beaux.
马具上的花纹特别精美。
6.
Les motifs réels de sa démarche .
他的活动的真实动机。
7.
La réussite le motive à poursuivre .
成功促使他继续努力。
Motif是什么意思
motif英 [məʊˈti:f] 美 [moʊˈti:f]
第三人称复数:motifs
motif 基本解释
名词(文艺作品等的)主题; (音乐的)乐旨,动机; 基本图案
motif到底是什么
来自联川生物
有特征的短序列,一般认为它是拥有 生物学功能 的 保守序列 ,
并不局限于 基因组DNA序列 还是 RNA序列 ,甚至 蛋白质序列 也可以提取出相应的motif
当某一个大类的序列中, 大量重复出现 相同的序列结构的时候,就可能存在探索它意义的价值
可能包含特异性的结合位点,或者是涉及某一个特定生物学过程的有共性的序列区段。
比如 蛋白质 的序列特异性结合位点,如 核酸酶 和 转录因子 。 转录因子 的结合位点,其motif往往意味着 某蛋白结构域 与 DNA碱基序列 的相互作用。
基于motif序列的提取,我们可以 预测潜在的结合位点
Protein domain是一种结构实体,通常代表 蛋白质 结构中 独立折叠和行使功能 的一部分
a.logo展示图: 这样的logo经常用于描述序列特征,如DNA中的蛋白质结合位点等。motif logo由每个位置的一堆字母组成。字母的 相对大小 表示它们在序列中的 频率 。每个字母的 高度 与该位置的相应碱基的 出现频率成正比 ,常以bits为单位。每个位置的字母按照 保守性 从大到小排列,可以方便的从 顶端的字母识别保守序列 。
b.一致性序列: 用一段序列来描述所有序列的碱基组成,称之为一致性序列。当一个位置涉及到多个碱基出现的时候,这里就涉及到简并碱基的使用。
c.PFM矩阵 :(position frequency matrix),用于代表motif的 碱基分布频数
和FASTA文件类似,有一个“”开头的ID信息。下面的每一行分别代表4个碱基,每一列分别代表一个位置。矩阵信息的即表示A, C, G, T 4种碱基在每个位置的频数分布。
模体(motif)英文解释是什么?
模体(motif)表示具有特定功能的或作为一个独立结构域一部分的相邻的二级结构的聚合体,它一般被称为功能模体(functional motif)或结构模体(structural motif),相当于超二级结构(super-secondary structure).模体和结构域一起组成了蛋白质的三级结构.
结构模体作为结构域的组分,介于蛋白质二级结构和三级结构之间,由相邻的二级结构单元彼此相互作用,组合在一起,排列成规则的,在空间结构能够辨认的二级结构组合体,并充当三级结构的构件,其基本形式有aa、bab和bbb等.多数情况下,只有非极性残基侧链参与这些相互作用,而亲水侧链多在分子的外表面.
常见模体:
(1)左手超螺旋——3根右手a-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋;
(2)右手超螺旋——3根左手螺旋拧到一起形成一个右手超螺旋,如胶原蛋白;
(3)卷曲螺旋——相邻的2根右手a-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋;
(4)螺旋束——多个a-螺旋的聚合体;
(5)b-折叠-a-螺旋-b-折叠,即bab;
(6)b-发夹环——两个反平行b-股由一个环相连;
(7)a-螺旋-b-转角-a-螺旋,即aba;
(8)a-螺旋-环-a-螺旋(EF手相);
(9)Ros**ann卷曲——也称Ros**ann折叠,它由两个bab连在一起,形成babab结构,通常能结合辅酶I;
(10)希腊钥匙模体——是一种全b折叠聚合体,存在于许多不同类型的蛋白质中,因在拓扑学上像古代花瓶上的希腊钥匙而得名,清蛋白原就含有这种模体.
模体是刻画蛋白质家族组成结构和执行功能的重要部分,但是对于通过各种生物信息学方法识别出的模体,目前没有很好的办法辨别真假和优劣.文中提出一种新的模体评价策略,从分类器的观点出发,对不同方法在同一个蛋白质家族上建立的不同模体进行比较,从而推断出最具有生物意义的模体.本文在PROSITE数据库中选取7个细胞因子家族,采用MEME和HMMER两种模体识别方法分别识别每个家族的模体,将每个模体看作一个分类器,通过计算同一家族的每个模体的敏感性和特异性并比较它们对应的接收机操作特性曲线,进而比较不同模体,确定真的模体和排除假的模体,从而获得每个蛋白质家族的最佳模体的模型.这种策略可以应用于对任意蛋白质家族模体识别结果的评价.此外,还可以利用最佳模体搜索数据库的结果预测每个家族的新成员.