福州大学土木工程学院在国内是颇有实力的。其结构工程是国家重点（培育）学科，土木工程新技术与防灾减灾是“211工程”国家重点学科建设项目，结构工程、桥梁与隧道工程和岩土工程是福建省重点学科。已有土木工程一级学科博士点及博士后科研流动站，拥有结构工程、桥梁与隧道工程、岩土工程、市政工程、防灾减灾与防护工程、水工程安全与水灾害防治、供热供燃气通风及空调工程等7个二级学科博士点，以及8个二级学科硕士点。

福州大学土木工程在上一轮教育部组织的学科评估中排名国内第25位。